Vesiterapia soveltuu koirien kuntoutukseen tuki- ja liikuntaelinvaivoissa. Siitä hyötyvät nivelrikosta kärsivät koirat, neurologisista ongelmista kuntoutuvat koirat, ylipainoiset koirat  ja esimerkiksi polvi- tai lonkkaleikatut koirat.

Vesi kannattaa koiran painoa, jolloin ontuvakin koira pystyy vedessä harjoittelemaan mahdollisimman normaalia askeltamista. Esim. koiran rintakehään asti ylettyvä vesi kannattaa jo noin 60 % koiran painosta. Vesi myös vähentää turvotusta ja helpottaa kipua. Nivelten liikeratoja saadaan veden avulla lisättyä ja tasapainon hallinta parantuu. Hyvä tasapaino ja koordinaatio auttavat ennaltaehkäisemään uusia vaivoja.

Vesialtaan pohjalla on juoksumatto, jotta koira voi kävellä altaassa eteenpäin. Jos koira pitää vedestä, vesikuntoutukseen totuttaminen käy yleensä helposti. Nekin koirat, jotka eivät veteen vapaaehtoisesti mene, yleensä ensimmäisen kerran aikana huomaavat, että vedessä on helppo kävellä.

Vesikuntoutuksen aikana omistaja on altaan edessä ja voi palkita koiraa kävelyn lomassa esim.makupaloilla. Harjoituksen jälkeen koira autetaan pois altaasta. Kävelyaika ja nopeus riippuvat eläimen kunnosta ja siitä miten se jalkojaan vedessä käyttää. Väsymys saattaa yllättää koiran vedessä nopeastikin, jolloin harjoitus lopetetaan. Vedessä kävellään tilanteen mukaan 2-20 minuuttia.

Selkäleikatut koirat (välilevyprolapsi) autetaan altaaseen yleensä kolmantena - neljäntenä päivänä leikkauksesta. Jos koira on vielä halvaantunut, sitä voidaan kannatella valjaiden ja pelastusliivin avulla. Kuntoutusta jatketaan yleensä 2 x vk ainakin 5-6 viikkoa. 

Nivelleikkausten jälkeen kuntoutus aloitetaan leikkaustyypin mukaan 1-2 vk:n kuluttua leikkauksesta.